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市对外贸易经济合作局设11个职能科（室）：
（一）办公室
负责重要会议的组织和会议决定事项的督办；负责重要文件的起草、政务信息的综合上报；负责公文处理、秘书业务、办公自动化、新闻报道、机要保密、文印通信、档案管理、机关安全保卫工作；负责外出参观学习活动的联系安排和访问本局的重要宾客的接待工作；负责局机关行政事务管理。
（二）计划财务科
负责编报外经贸中长期规划和年度进出口指导性计划及部分进出口商品配额、年度计划并协调组织实施；会同有关部门研究、落实涉及外经贸的外汇、税收、信贷、价格、保险等政策，参与外经贸出口退税管理；负责外贸宏观运行状况的监测、统计分析及信息发布工作；会同有关部门管理国家安排扶持外贸出口的各项外贸专项资金，提出对口岸建设资金和补助基金分配、使用的意见；负责局机关经费和内部财务审计工作，指导外经贸行业的财会业务。
（三）对外贸易发展科
拟订全市对外贸易发展战略、发展规划方案，提出促进对外贸易发展的建议；会同有关部门拟订开拓国际（境外）市场规划，研究和推广各种新贸易方式（含电子商务）；依照法律、法规核报或核准各类企业的进出口经营资格和国际货运代理资格；申办和组织赴国（境）外举办展销会、洽谈会；协办、监管境内各种外经贸交易会、展览会等。
指导海外市场开发、规范经营秩序；负责境外设立企业（机构）的审核和宏观管理工作；负责对境外承包工程、劳务合作，设计咨询项目的审核申报工作；负责进出口企业电子口岸的资料审核；处理对外经济合作有关重大事件。
（四）对外贸易管理科
管理进出口商品配额，组织实施出口配额招标，管理进出口许可证；负责纺织品配额许可、专用产地证的管理、打制和送签；负责易制毒化学品的进出口管理，管理进出口商品目录；管理出口商品商标注册登记后的有关事务；负责供应香港、澳门特别行政区鲜活商品的协调工作；联系进出口商会。
执行机电产品进出口政策、管理规章、中长期规划和年度配额的年度进口方案；贯彻执行进口机电产品招标规划和管理办法并组织实施；分析机电产品进出口情况并定期报送有关动态。
负责外经贸科技发展、技术进步和出口商品质量、品牌及标准化的协调管理；执行对外技术贸易的政策、管理规章以及鼓励技术和成套设备出口政策，协调管理技术和成套设备及高新技术产品的出口；管理技术引进、设备进口，参与国际招标。
（五）外资管理科
参与制订吸收外商投资的发展战略、中长期规划和年度指导性计划；参与拟订外商投资的政策、管理规章；审核或核报国家规定限额的外商投资项目的设立，核报外商投资项目的合同、章程及其变更；分析外商投资发展情况，定期向市人民政府和省外经贸厅报送有关动态并提出有关建议。
参与制订改善投资环境的政策措施；编制招商计划和招商目录。指导和协调招商引资促进工作；参与组织全市性的大型外经贸洽谈、招商引资、展销等重要活动。
（六）加工贸易科
宏观管理加工贸易工作，核准属市管理权限的加工贸易业务；分析加工贸易发展情况，定期向市人民政府和省外经贸厅报送有关动态；监督检查外商投资企业执行法律、法规和合同、章程的情况，会同有关部门对外商投资企业进行联合年检工作；指导、管理外商投资企业的进出口；管理外商投资企业进出口许可证配额；负责重要工业品、原材料进出口计划组织实施等有关的职能以及重要工业品自动进口许可证配额的管理；管理进口关税配额；编制外商直接投资年度计划，负责外商投资统计及分析。
（七）国家口岸科
负责一类口岸的开放、关闭及调整等业务的审核、申报和组织实施；负责组织制订和实施全市一类口岸的发展规划及配套建设计划；负责市直一类口岸综合管理，协调处理口岸现场发生的矛盾和问题，指导五邑各市一类口岸的综合管理工作；负责起草有关一类口岸的管理制度，会同有关部门组织和实施一类口岸查验方法和监管模式的改革；督促查验单位按照各自职责和规定，做好出入境人员、交通工具及其行李物品的监管和检查工作；检查、督促口岸经营单位制定、落实建设计划，改善配套设施；组织口岸单位对干部、职工进行涉外政策、纪律教育，会同有关部门对口岸重大涉外问题和严重违纪违法的情况进行检查，提出处理意见；负责市直一类口岸的安全检查和治安综合治理的组织、监督工作，保证口岸安全畅通；组织开展共建文明口岸活动，会同有关单位解决查验单位工作、生活方面的实际困难。
（八）地方口岸科
负责二类口岸的开设、关闭及调整的审核和综合管理；协调处理口岸现场发生的矛盾和问题；督促查验单位按照各自职责和规定，做好出入境人员、交通工具、货物监督管理、检查、检验；检查、督促口岸经营单位制定、落实口岸建设计划，改善配套设施；组织口岸单位对干部、职工进行涉外政策、纪律教育，会同有关部门对口岸重大涉外问题和严重违法违纪的情况进行检查，提出处理意见；组织开展共建文明口岸活动，会同有关单位解决查验单位工作、生活方面的实际困难。负责口岸业务综合统计工作。
（九）人事教育科
负责局机关及指导直属单位的机构编制、干部人事管理、纪检监察、培训教育、安全保卫和信访工作；会同机构编制主管部门审核呈报口岸查验单位机构设置和人员编制；组织参与国际商务专业人员的岗位资格考试和培训，协助有关部门开展国际商务专业技术资格的评审、考试工作；负责局机关人员的工资、医疗保险和计划生育管理工作；负责常驻人员的指标审核和管理工作。
（十）贸易促进科（挂中国国际贸易促进委员会江门市支会牌子）
负责组织、协调开展促进对外贸易、吸引外资、引进国外先进技术及各种形式的中外经济技术合作等活动；组织工商企业及有关团体出访考察；组织相关企业参加国内、外举办的展销会、展览会、经贸洽谈会、研讨会、新闻发布会等；承办出口商品原产地证明书以及出口发票等对外贸易单据的认证工作；联络海内外商社及工商团体，接待海外商社及经贸界人士的来访、考察；发展贸促会会员；提供有关外经贸方面的信息咨询服务；宣传我市投资环境，开展招商引资工作。
（十一）政策法规科（挂进出口公平贸易局牌子）
负责外贸法规政策的宣传、贯彻和实施；参与草拟地方性的相关政策、管理办法，并组织实施；负责行政复议、行政诉讼及相关的法律事务；指导和协调我市企业参加世贸组织其他成员方对我市出口商品的反倾销、反补贴和保障措施调查的应诉及相关工作；负责反倾销、反补贴和保障措施等案件的倾销幅度调查和产业损害调查，建立产业损害预警机制；指导并协调市内有关部门和相关中介组织产业安全方面的工作。 | 
