近年来，小鸟天堂加强榕树、鸟类、水系、滩涂、鱼虾、植物等生态保育，全力禁止在小鸟天堂范围内和水域周边垂钓、捕鱼、捞虾、捕鸟、水质污染等破坏生态环境的行为。
新会小鸟天堂旅游有限公司经理叶增雄：“从2011年开始，我们和天马村委会联动，成立了护鸟队。另外，我们这几年投入了大量资金，在小鸟天堂内部架设了超过100支监控枪，对小鸟和周边环境实施24小时实时监控。为了加强人们对鸟类的保护意识，小鸟天堂每年坚持举办‘爱鸟周’等活动。”
为减少人类活动对鸟类生存环境的影响，我区将距离小鸟天堂核心区130米的天马中学搬迁，以每年150多万元的租金租下原天马中学校舍，改作鸟类科普监测用途。同时，广东新会小鸟天堂国家湿地公园管理处挂牌成立，通过实施湿地保护与恢复工程，建立起以榕树群落为主的，由水域、林地与滩涂组成的湿地生态系统保护体系；采取适宜的人工辅助措施，把湿地公园建成为一个吸引更多鸟类聚居、停歇的小鸟天堂。
此外，我区将位于湿地公园规划范围的部分建设用地转为绿地，永久保护，为鸟类提供充足的觅食生活空间。同时，实施拆旧复垦，优化小鸟天堂周边环境。
距离小鸟天堂核心保护区约800米的地方，是粤西连接珠三角地区最快的铁路通道——江湛铁路。为了给这里的鸟类创造一个安静的栖息环境，线路投资增加约1.8亿元，安装长达两公里的全球首例拱形全封闭声屏障进行降噪。江湛铁路所产生的噪声并没有对小鸟天堂生态环境造成影响。
我区还投入4.7亿元，加大上游黑臭水体综合治理，重点整治小鸟天堂湿地公园上游的英州海（城区段）。
小鸟天堂将以生态、环保、自然为主要导向，旅游功能逐渐向湿地公园的功能转变。划定落实湿地保护红线，禁止任何可能危及生态安全的开发行为，确保小鸟天堂湿地面积不减少、性质不改变、功能不退化。
新会小鸟天堂旅游有限公司经理叶增雄：“接下来，小鸟天堂的重点工作是维护湿地的自然状态，以湿地恢复为重点，组织编制好小鸟天堂湿地公园保护的实施规划。大力开展宣传教育，提高社会对湿地的保护意识，形成珍爱湿地、保护湿地、支持湿地保护工作的良好社会氛围。”
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